明朝万历年，倭寇联合朝中奸细陷害兵部尚书邱大人全家，唯小女儿邱莫言被江湖侠客周淮安救下，邱大人临死前将明朝海防布防图交予女儿，希望等朝中清明之时将这关乎明朝安危的布防图托付给能担大任之人。倭寇为了得到布防图在江湖上追杀周淮安、邱莫言二人，朝廷也将二人列为天字第一号通缉犯，为了布防图和邱家后人的安危，周淮安找到了龙门客栈老板娘金镶玉帮忙，金镶玉为了心中挚爱将布防图藏在客栈之中，将客栈改成一艘龙船隐藏于江湖之外，在合适的时机到来之前保护好布防图，可没想到邱莫言无意间落入倭寇手中，与此同时朝廷也派出了破案高手徐宜来到船上捉拿周淮安、邱莫言，几股势力为了各自的目的在这艘诡异的龙船之上展开了殊死争斗。
公元697年，大周皇帝武则天钦定八月十五在谷泉镇大坝附近的祭台举行祭鼎大典，以稳固皇权。 八月十二，谷泉大坝发生龙神诅咒事件，多人身体异变，被守护龙神宝藏的妖龙吞噬而亡。龙神诅咒事件不断发生，更为离奇的是，一直不相信龙神诅咒的水部员外郎王巍禾在上朝面圣时龙化并攻击皇帝武则天。 狄仁杰奉旨查案，发现死者都与谷泉大坝下的龙神宝藏有关，随着调查的深入，守护宝藏的妖龙、龙神显圣、避水丹等陆续浮出水面，他凭借一双慧眼和严密的推理，发现龙神诅咒背后隐藏着一场巨大阴谋。 祭鼎大典召开在即，狄仁杰只得拼死一搏捍卫皇城百姓，然而等待他的却是更加残酷的现实…… 维护皇权还是心系百姓？狄仁杰在两难抉择中艰难前行。
